前回までの記事では、eDESIGNERというオープンソースのツールを使って、DELのデザインを行ってきました。しかし、実際にデザインしたDELにどのような構造の化合物が含まれているかは確認できていませんでした。一つのDELでも数千万〜数億の構造を含むことも…

前回まででeDESIGNERのメインの機能は使い終わりましたが、全スクリプトの半分ほどしか使っていませんでした。他のスクリプトはどんな機能があるのか見ていきましょう。 e_bb_retriever.py sample_generator.py bbt_analyzer.py lib_bb_analyzer.py incompat…

前回までに引き続き、オープンソースのDELツールであるeDESIGNERの使い方です。今回はいよいよ本体のスクリプトを実行していきます。環境構築とBBT_input.txtファイルの作成はしてあるものとします。やり方は前２回の記事でまとめています。 DNA Encoded Lib…

オープンソースツールのeDESIGNERの使い方を書いていきます。今回は、eDESIGNERで使う試薬(Building Block, BB)ファイルはどのような形で用意すれば良いかという所までを扱います。

DNA Encoded Library (DEL)用のOSSであるeDESIGNERの使い方を紹介します。準備編として、概要の紹介と環境構築を扱います。